Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROCCQ5TZA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms