Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms