Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRTP1Q5TC63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRTP1Q5TC63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms