Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPDC1Q5TB30 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPDC1Q5TB30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPDC1Q5TB30 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms