Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C2Q5TAH2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC9C2Q5TAH2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms