Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM78Q5T7P6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM78Q5T7P6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms