Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F0

DCAF12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF12Q5T6F0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF12Q5T6F0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF12Q5T6F0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF12Q5T6F0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms