Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATAD3CQ5T2N8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms