Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3LQ5T215 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC3LQ5T215 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms