Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF678Q5SXM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF678Q5SXM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF678Q5SXM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF678Q5SXM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF678Q5SXM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF678Q5SXM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms