Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF14Q5SWL7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF14Q5SWL7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms