Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2D4BQ5SQS7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms