Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB41Q5JT25 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB41Q5JT25 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms