Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC92Q53HC0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC92Q53HC0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms