Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6AP1LQ52LC2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1LQ52LC2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6AP1LQ52LC2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms