Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKDCCQ504Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDCCQ504Y2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms