Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms