Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAL1Q4LDG9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAL1Q4LDG9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms