Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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KRTAP13-4Q3LI77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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KRTAP13-4Q3LI77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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KRTAP13-4Q3LI77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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