Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL40Q2TBA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms