Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC6LQ2NKX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms