Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB5Q2M3G0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB5Q2M3G0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms