Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIDA1Q1XH10 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms