Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSPP1Q1MSJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms