Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL24A1Q17RW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL24A1Q17RW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
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