Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL8BQ17RB0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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