Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFA9Q16795 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NDUFA9Q16795 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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NDUFA9Q16795 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDUFA9Q16795 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NDUFA9Q16795 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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NDUFA9Q16795 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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