Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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HIST2H2BEQ16778 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIST2H2BEQ16778 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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HIST2H2BEQ16778 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIST2H2BEQ16778 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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