Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPPQ16740 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPPQ16740 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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