Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK5Q16478 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms