Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USF2Q15853 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USF2Q15853 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USF2Q15853 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USF2Q15853 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USF2Q15853 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USF2Q15853 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USF2Q15853 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USF2Q15853 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USF2Q15853 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USF2Q15853 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USF2Q15853 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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