Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VAMP3Q15836 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP3Q15836 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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