Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RABEP1Q15276 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP1Q15276 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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