Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRLQ15198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
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