Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK3Q15120 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK3Q15120 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK3Q15120 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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