Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KARSQ15046 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KARSQ15046 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KARSQ15046 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KARSQ15046 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KARSQ15046 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KARSQ15046 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KARSQ15046 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KARSQ15046 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KARSQ15046 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KARSQ15046 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KARSQ15046 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KARSQ15046 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KARSQ15046 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KARSQ15046 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KARSQ15046 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KARSQ15046 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KARSQ15046 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KARSQ15046 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KARSQ15046 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KARSQ15046 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KARSQ15046 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KARSQ15046 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KARSQ15046 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KARSQ15046 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KARSQ15046 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KARSQ15046 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KARSQ15046 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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