Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 214.16□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 MOGS-209ENST00000489655 489 ntTSL 36.41□□□□□ -1.388e-7■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 TSEN54-205ENST00000578415 994 ntTSL 319.39■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 TSEN54-211ENST00000583818 765 ntTSL 516.21■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 TSEN54-210ENST00000583634 282 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 SSBP4-207ENST00000600244 622 ntTSL 215.99■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 50.4
EFTUD2Q15029 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 515.25■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 50.4
EFTUD2Q15029 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 312.82□□□□□ -0.366e-11■■■■■ 50.4
EFTUD2Q15029 SHMT2-219ENST00000555563 895 ntTSL 513.15□□□□□ -0.35e-8■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 SHMT2-227ENST00000557269 576 ntTSL 512.65□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 SHMT2-214ENST00000554604 879 ntTSL 512.27□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 SHMT2-223ENST00000556689 768 ntTSL 311.7□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.32e-10■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.242e-10■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-26■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-16■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 29.31□□□□□ -0.923e-16■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 EIF2B4-203ENST00000417567 761 ntTSL 517.42■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 THOC6-203ENST00000571046 614 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-15■■■■■ 50.3
EFTUD2Q15029 CYB5B-203ENST00000514123 2492 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 AP1M1-205ENST00000586543 642 ntTSL 510.28□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-46■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.36e-9■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.896e-9■■■■■ 50.2
EFTUD2Q15029 UBXN6-209ENST00000592515 403 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 50.1
EFTUD2Q15029 TRIP10-213ENST00000601303 311 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-15■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 UNC45A-206ENST00000486253 1507 ntTSL 217.82■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 NPLOC4-215ENST00000574095 277 ntTSL 324.51■■□□□ 1.511e-8■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 RECQL5-212ENST00000580707 948 ntTSL 316.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 NPLOC4-203ENST00000570300 565 ntTSL 411.07□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 PHF5A-202ENST00000459687 504 ntTSL 36.04□□□□□ -1.449e-7■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 522.56■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 322.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 318.15■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 215.8■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 50
EFTUD2Q15029 TRMT1-208ENST00000587487 813 ntTSL 312.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 49.9
EFTUD2Q15029 PLCD1-202ENST00000417185 685 ntTSL 214.41□□□□□ -0.14e-12■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ZCCHC4-204ENST00000507760 2045 ntTSL 1 (best)22.3■■□□□ 1.161e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 HOOK1-203ENST00000465876 2228 ntTSL 222.05■■□□□ 1.121e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-220ENST00000581519 545 ntTSL 419.76■□□□□ 0.751e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 HOOK1-202ENST00000455990 519 ntTSL 419.51■□□□□ 0.711e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ZCCHC4-203ENST00000505451 1504 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ELF3-207ENST00000479874 330 ntTSL 314.68□□□□□ -0.061e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 BCL3-204ENST00000464319 439 ntTSL 213.79□□□□□ -0.21e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 BCL3-205ENST00000473468 587 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ELF3-205ENST00000470384 500 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 FBRSL1-208ENST00000543453 205 ntTSL 39.91□□□□□ -0.821e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 ZCCHC4-202ENST00000505412 1903 ntTSL 37.22□□□□□ -1.251e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 24.19□□□□□ -1.741e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 33.73□□□□□ -1.811e-11■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 C1orf35-207ENST00000492757 548 ntTSL 320.29■□□□□ 0.845e-8■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 316.31■□□□□ 0.26e-35■■■■■ 49.8
EFTUD2Q15029 MLLT1-202ENST00000585588 637 ntTSL 315.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 518.14■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 49.7
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EFTUD2Q15029 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.211e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.211e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.081e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.061e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-203ENST00000440286 960 ntTSL 520.91■□□□□ 0.941e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-209ENST00000612051 1972 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.91e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-210ENST00000615186 488 ntTSL 520.43■□□□□ 0.861e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.847e-14■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-201ENST00000413620 892 ntTSL 519.24■□□□□ 0.671e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-204ENST00000586789 993 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 VARS-220ENST00000461874 845 ntTSL 517.73■□□□□ 0.434e-8■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-203ENST00000586439 744 ntTSL 517.69■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-205ENST00000492469 552 ntTSL 517.35■□□□□ 0.371e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.061e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 THAP9-205ENST00000514244 821 ntTSL 514.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-202ENST00000422680 841 ntTSL 212.97□□□□□ -0.331e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-206ENST00000589591 542 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CASP3-204ENST00000447121 549 ntTSL 312.35□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 RALGDS-207ENST00000460587 674 ntTSL 312.25□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 THAP9-204ENST00000509353 700 ntTSL 512.05□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-202ENST00000585842 368 ntTSL 211.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-204ENST00000445622 693 ntTSL 511.47□□□□□ -0.571e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 ARF3-207ENST00000541236 485 ntTSL 211.4□□□□□ -0.581e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 POLR2I-207ENST00000592962 493 ntTSL 211.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 TROAP-204ENST00000546776 1011 ntTSL 311.13□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 MTHFD1-210ENST00000555252 2053 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 IKBKG-213ENST00000617838 285 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.681e-13■■■■■ 49.7
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