Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC7Q15024 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC7Q15024 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC7Q15024 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms