Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A2Q14055 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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