Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP5Q14008 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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