Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTCH1Q13635 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTCH1Q13635 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
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