Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTMR1Q13613 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTMR1Q13613 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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