Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC1Q13547 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC1Q13547 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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