Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK1Q13546 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK1Q13546 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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