Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME3Q13232 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME3Q13232 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME3Q13232 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME3Q13232 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME3Q13232 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME3Q13232 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NME3Q13232 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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