Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHAF1AQ13111 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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