Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PRDM2Q13029 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PRDM2Q13029 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
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