Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTP4A2Q12974 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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