Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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