Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP53BP1Q12888 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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